当狮子Alex等还在非洲悠闲度日时,四只企鹅已经回到纽约中央动物园执掌管理大权,与此同时他们还要执行各种秘密任务。

因为背上了变节者的恶名，年轻的英雄团队G.I.Joe被迫为了保卫自己的名誉，开始和眼镜蛇组织开战，那是一个看是仁慈的企业，企图重建世界新秩序。G.I.Joe为了和平、正义，同眼镜蛇开始了持久的战斗，他们风趣、幽默，动作迅捷，赢得了无数…