该剧讲述了Fry，一位20世纪的年轻人在30世纪的冒险经历。PhillipFry是一个纽约市的25岁的比萨饼快递员，他的生活就是每天四处奔波，1999年12月21日他偶然的被冰冻了起来,当他醒过来时已是1000年以后，他也有了一个开始新生活的机会.他到…

邪恶的可汗逃脱十五年前被寇克船长拘禁的星球，他本人是一位智勇双全的领袖，但此刻已变成一个邪恶的狂人，他誓言要向寇克船长讨回血仇。于是他先劫持了一艘联邦战舰，后又偷取了寇克船长的儿子和旧情人制造的毁灭性武器。并引诱企业号投…

　　寇克将军，欢迎您重返企业号！ 　　一团硕大无朋的高能离子云，在遥远而神秘的太空中迅疾地飘移。这团能量云具有无坚不摧的威力，足以毁灭宇宙间任何物质结构。在它所划过的轨迹上，早已有好几艘分属银河三大势力的星舰遇难了……

　　2285年，在与可汗的战斗中损坏的联邦星舰进取号，返回了地球的太空港以进行维修。柯克还在为斯波克的死感到悲伤。麦科伊医生出现了种种异常的行为：如擅自闯入被封锁的斯波克原来的舱房、胡言乱语等，最后他被送进了医院进行精神检查…

以变态、暴戾手法强暴虐杀无数女性的杀人狂柏德烈贝文，终于消失人间。可惜，他的消失并没有将恐怖杀机一同埋葬。丽楚纽曼是贝文多宗虐杀案中的唯一生还者，事隔多年，丽楚已是标致可爱的大学生，一切似乎归于平静安稳，丽楚亦定下新目标…

寇克船长奉命最后一次指挥企业号宇宙飞船对抗外星人对地球的大规模攻击，他召集旧部和新队员执行任务，双方展开了一场殊死战斗。第一部的前半部几乎全是讲科克船长召集旧部来执行任务，开场就是久违的企业号穿越太空，科克船长成功的掌握…

一名神秘的疯狂幻想家赛布克占领了一个遥远的星球，劫持星际大使作人质，强迫企业号宇宙飞船紧急出发，进入没有人做访过的未知宇宙去寻找传说中的上帝，但上帝到底是谁呢......