X档案关闭后，穆德（David Duchovny 大卫·杜楚尼 饰）和斯科莉（Gillian Anderson 吉莲·安德森 饰）被分开。穆德受命执行监听工作，斯科莉则回到学院读书。某日国会议员麦特森（Raymond J. Barry 饰）向穆德透露一条消息，称在…

沿续上一季的剧情，穆德被印第安人朋友Albert Hosteen救了性命。X档案的编剧似乎有用不完的点子。这季内容包括了湖中水怪、能控制人意识的精神病患、唐人街上的纷争、二次大战时日本的人体实验等等。

到这季开始时，X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激，但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。第四季仍是过去一贯的风格，但加入了许多穆德、史考莉的个人生活。在该季中，“黑油”“天花蜂”的出现使有关“真相”的调查…

继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。…

该剧的主题是外星人，特异功能以及种种科学不能解释的超自然现象。联邦调查局探员mulder因妹妹在8岁时的遭外星人人绑架失踪，从此对外星人以及种种超自然现象的存在深信不疑。而他的搭档scully探员对怪诞现象心存怀疑，她认为没有科学不…

穆德远途调查出了意外，在精神病院醒来有了预见的能力，还能读取他人的心理活动。史考莉在非洲海岸发现那里发现了刻有人类基因图的远古遗物及关于第六次物种大灭绝的记载。癌人一直在进行外星混血儿的试验，注入病毒已检验是否成功，这个…

穆德失踪后，史考莉返回FBI总部请约翰·道吉特探员帮忙寻找她的搭档，但无任何结果。于是，她与史基勒一起找到了孤枪侠，希望能够发现穆德失踪时UFO的活动情况以从中找到线索。经过一番调查，他们发现了一个名叫吉布森·佩雷茨的人，但此…

美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历一起离奇神秘的绑架案，他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持，至今下落不明。从此穆德便专注于神秘事件的研究，并专门负责FBI总部的X档案部门。因穆德行事乖张，…